免费封装APP的原理是将已经开发好的应用程序打包成安装文件(APK)。这种打包方式需要一个专业的打包工具，比如AndResGuard、360加固助手、乐固、爱加密等，它们可以将应用程序进行加密保护，防止被反编译或者二次打包。

在选择免费封装APP的工具时，可以考虑以下因素：

1.操作难易度：如果你不熟悉工具的操作，那么难度便成了一个重要的参考因素。优秀的工具应该具有图形化的用户界面，能够让你快速熟悉和了解其基本操作。

2.保护效果：好的封装工具可以对APP的核心代码进行混淆、压缩、加固等处理，有效避免被反编译和二次打包的情况。因此，在选择封装工具时需要重视其保护效果。

3.性能影响：封装工具对APP的性能有一定影响，因此需要选择对性能影响较小的工具。一般来说，采用签名保护的方式对APP进行封装，对性能影响较小。

4.兼容性：不同的封装工具对不同的安卓系统版本、厂商之间的兼容性可能会不同。因此在选择封装工具时，需要对应用程序的目标安卓系统版本和目标设备的品牌做一定的了解和匹配。

总的来说，选择一款好的免费封装应用程序的工具需要重视其操作难易度、保护效果、性能影响和兼容性等综合因素。